Izba Reprezentantów
W roku 1994 zdobył nominację Partii Republikańskiej jako jej kandydat na kongresmana z 2. okręgu stanu Oklahoma (w którym mieści się Muskogee). region ten uchodził dotychczas zbytnio fort Partii Demokratycznej.
Początkowo spodziewano się, że jego przeciwnikiem będzie zasiadający z izbie odkąd 1979 Mike Synar, tymczasem ten, co było na obiekt wielu dużym zaskoczeniem, został pokonany w prawyborach demokratycznych przez 71-letniego dyrektora szkoły Virgila Coopera. Coburn wygrał wybory stosunkiem 52%–48% głosów, zostając przeto pierwszym republikaninem z 2. okręgu, kto zasiadał w Izbie odkąd roku 1921.
Jako kongresman ogólnie uznawany był zbytnio konserwatystę. Zasiadając w izbie opowiadał się m.in. zbytnio redukcją budżetu federalnego oraz ograniczeniem prawa aż do przerywania ciąży. czasem wbrew tego wyłamywał się z dyscypliny partyjnej także popadał w konflikty na tym tle z wpływowym spikerem Izby, Newtem Gingrichem.
W roku 1997 Coburn był sponsorem ustawy w sprawie przecidziałania AIDS, która nie została przyjęta. Przewidywała, iż wszyscy zakażeni wirusem HIV nie będą mogli z tego tytułu żadnych urzędów w publicznej służbie zdrowia.
Coburn przyrzekł na przestrzeni swej pierwszej kampanii wyborczej, iż opuści Izbę po trzech dwuletnich kadencjach. na przestrzeni republikańskich prawyborów prezydenckich w 2000 poparł byłego dyplomatę także konserwatywnego działacza Alana Keyesa, tymczasem później stał się jednym z w najwyższym stopniu żarliwych popleczników prezydenta George'a W. Busha. Jego punkt w Izbie zajął demokrata Brad Carson.